Studium se řídí ISP studenta, který jej po projednání a souhlasu školitele předkládá oborové radě ke schválení zpravidla do jednoho měsíce po zahájení studia. ISP je pro všechny zúčastněné strany závazný. Jeho odůvodněné změny se uskutečňují na základě písemné žádosti doktoranda po souhlasu školitele nebo na základě žádosti školitele po projednání s doktorandem a podléhají schválení oborovou radou. ISP je každoročně upřesňován a jeho plnění je na konci každého roku studia na základě písemných podkladů, které předkládá doktorand a vyjadřuje se k nim školitel, hodnoceno oborovou radou.
ISP obsahuje zejména:
Všechny povinnosti stanovené oborovou radou a školitelem musí být explicitní součástí ISP. ISP předpokládá, že doktorand absolvuje během studia 3 povinně předepsané předměty a volí z nabídky volitelných předmětu 3 předměty, přičemž nejméně 1 z nich je z bloku c (předměty s tématikou metod výzkumu, hodnocení a interpretace dat).
